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Top of page2008年10月24日～2008年11月21日
1: 不同人種之間的基因差異
本期Nature介紹的兩項重大協作研究工作，展示了最新大規模併行合成DNA測序技術的威力，這兩項研究為了解基因組隨種族變化而變化的性質提供了線索。第一篇論文描述了對來自西非Yoruba族群的一個人的基因組定性研究。第二篇論文報告了一個漢族人的個人基因組，漢族佔世界人口總數的30%。現在，這些新的資源可與Venter、Watson和NIH的參考序列結合起來使用。另一項單獨的研究工作，根據來自超過30個歐洲國家的1,387人的數據，在大陸尺度上對遺傳種族問題進行了研究。總體上來說，國與國之間幾乎沒有遺傳差異，但的確存在的差異與地理位置有密切對應關係。對該基因組數據所做統計分析表明，這些人中50%在他們自己所說的起源地的310公里之內。這項工作除了對驗證遺傳世系有參考意義外，對於評估將基因與疾病聯系起來的基因組範圍內的關聯研究也有意義。（Articles pp. 53, 60; News & Views）
doi:10.1038/nature07517
Nature vol.456 (7218, 6 Nov 2008) Articles p.53
2: 地球上出現光合作用的最早時間被修正
關於地球上能夠生成氧氣的光合作用，被人們廣泛接受的最古老的證據來自從澳大利亞Pilbara Craton距今27億年前的頁岩中提取出的烴類生物標記，它們被認為是真核生物及光合作用藍藻的證據。這麼早的時間引起了一些爭議，因為在能夠產生氧的藍藻在地球上最早出現的這個時間與大約3億年後引起大氣中氧含量增加的“大氧化事件”（great oxidation event）有一個很長的時間延遲。由Rasmussen等人所做的新的研究工作表明，有機生物標記不是太古代的，一定是在晚些時候、在距今大約22億年前之後進入岩石的。因此，真核生物及藍藻出現在地球上的最早的、明確無誤的化石證據分別應該被糾正為在距今17.8億∼16.8億年前和21.5億年前。
doi:10.1038/nature07381
Nature vol.455 (7216, 23 Oct 2008) Letters to Nature p.1101
3: 酵母蛋白組的量化研究
一項將高分辨率質譜、“SILAC”標記和計算蛋白組學方法結合起來的研究工作，被用來實現蛋白組學中的一個重要目標：一個蛋白組的完全識別和量化。該研究發現了一個由多達4,399單個內生蛋白組成的蛋白組，就在正常生長的酵母細胞中所表達的蛋白而言，這實質上是一個完整的蛋白組。研究人員將單倍體細胞中這些蛋白的水平與雙倍體細胞中它們的水平進行了對比。除了其他差別之外，雙倍體中細胞壁成分的含量也顯著降低，這與雙倍體比單倍體大兩倍、但並沒有兩倍大的表面積這一事實是一致的。
doi:10.1038/nature07341
Nature vol.455 (7217, 30 Oct 2008) Letters to Nature p.1251
4: 費米液體與金屬鐵磁性
傳統金屬的低溫性質可用費米液體理論很好地描述，該理論將電子當成由散射的、但卻並不發生相互作用的實體所構成的一種氣體來處理。但有趣的是，人們正在發現費米液體理論在其中失效（失效的方式經常是很神秘的）的一些金屬體系的例子。Smith等人描述了這樣一個例子，在其中，非費米液體性質可被歸因於一個具體過程——在處於磁化邊緣的一種金屬中電子自旋之間的長距離相互作用。這樣一個體系被稱為“邊際”費米液體，它為經典金屬和更奇特的非費米體系之間提供了一個概念性聯系。
doi:10.1038/nature07401
Nature vol.455 (7217, 30 Oct 2008) Letters to Nature p.1220
5: 與成膠質細胞瘤有關的新基因
《癌症基因組圖集》（Cancer Genome Atlas）是一個旨在為與癌症相關的突變編目的大型基因組學項目，該項目目前已經開始產生結果。成膠質細胞瘤（最常見的腦癌）是該項目的第一個目標，其最初的結果9月4日首先在網上發布，現在出現在了印刷版的Nature上。新發現的與成膠質細胞瘤有關的基因包括一些腫瘤抑制因子（NF1、RB1、ATM和APC）和幾個酪氨酸激酵素基因。成膠質細胞瘤極為難以治療，因此開發一個可能的模型系統具有潛在重要性。Zheng等人報告，缺少腫瘤抑制因子p53和PTEN的小鼠會患與人類成膠質細胞瘤相似的腫瘤，同時Myc蛋白水平提高。除了為驗證相關療法提供一個潛在系統外，這一發現也說明c-Myc是一個可能的藥物作用目標。
doi:10.1038/nature07385
Nature vol.455 (7216, 23 Oct 2008) Articles p.1061
6: 微RNA是後生動物的一個早期特徵
微RNA（MicroRNAs）是1993年在線蟲中發現的抑制性小RNA分子，廣泛分布在複雜動物中。人們普遍假設，它們是當動物形成雙側對稱性（即動物身體結構複雜到有前部和後部以及上部和下部）時作為微調基因表達的一種方式而出現的。但新的研究工作（這項工作是基於對三種“基底後生動物門”的代表動物（一種扁盤動物、一種海綿和一種海葵）及一種單細胞“領鞭毛蟲”的總RNA內容所做測序進行的）表明，微RNA出現的時間要比人們以前所想的長得多。調控性微RNA通道似乎是在後生動物演化過程中非常早的時候出現的——是當多細胞生命方式出現時出現的，儘管這種機制後來在一些生命分支中丟失了。
doi:10.1038/nature07415
Nature vol.455 (7217, 30 Oct 2008) Articles p.1193
7: 轉錄因子Npas4是腦細胞中的“主開關”
激發性和抑制性突觸數量之間必須保持很好的平衡，神經回路才能發揮功能。人們對突觸、尤其是抑制性突觸依賴於活性的形成中所涉及的細胞內分子信號通道基本上不了解。一項新的研究發現，轉錄因子Npas4在腦細胞中起一個“主開關”作用，維持突觸激發和抑制之間的體內平衡，該平衡被認為在如自閉症、癲癇症和精神分裂症等神經疾病中受到破壞。Npas4通過調控超過200個依賴於活性的基因的表達來發揮作用，這些基因反過來又控制由GABA調控的突觸（它們形成激發性神經元）的數量。
doi:10.1038/nature07319
Nature vol.455 (7217, 30 Oct 2008) Articles p.1198
8: “暗物質”來自哪里
被認為形成宇宙大部分內容的“暗物質”的性質仍然不清楚。一種觀點是，它是基本粒子，也許是已知粒子的最輕的超對稱夥伴。如果真是這樣，那麼“銀河系”暈中暗物質的湮滅就應能在一個很快應可探測到的水平上產生伽馬射線。我們應在什麼地方尋找這些伽馬射線呢？Springel等人所報告的數值模擬表明，主導性的、最容易探測到的信號將由“銀河系”主暈中瀰漫的暗物質產生。以前人們認為，這種湮滅信號可能主要是來自靠近“銀河”系中我們太陽系所在部分的暗物質小團塊的輻射，但這項新的研究工作表明，它們的貢獻會比較小。
doi:10.1038/nature07411
Nature vol.456 (7218, 6 Nov 2008) Letters to Nature p.73
9: 中國新發現恐龍化石改寫恐龍—鳥類演化歷史
這裡是從非鳥類四足動物向鳥類過渡中的另一個篇章——一種奇特的、鴿子大小的長羽毛的恐龍從中國的中—晚侏羅紀地層中被發現。這種生物生活的年代比始祖鳥稍早一些，它在很多方面都像鳥，包括長有四個非常長的、絲帶一樣的尾羽和一個短尾。但沒有在像小盜龍那樣的鳥樣恐龍四肢上所看到的那種飛行羽毛的痕跡。在今天的鳥類中，加長的尾羽通常都是起裝飾作用的，這種古生物的尾羽也可能是起這種作用。這一新發現的化石，使得從恐龍向鳥類演化的早期歷史變得更複雜了。
doi:10.1038/nature07447
Nature vol.455 (7216, 23 Oct 2008) Letters to Nature p.1105
10: GSK-3在促進白血病病情發展中所起作用
絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酵素GSK-3（糖原合成酵素激酵素-3）是很多信號通道的構成部分，包括那些在糖原生產、細胞凋亡和干細胞維持中所涉及的信號通道。這些通道中的其中一些已被與人類疾病聯系在一起，而GSK-3抑制劑則被看作是糖尿病和阿爾茨海默氏症的可能治療藥物。現在，GSK-3被發現在支持急性白血病的病情發展中扮演一個以前人們未曾料到的角色——這個角色與人們根據其在抑制某些癌症中被異常激發的信號通道中扮演的已知角色所做出的預測是相反的。比較矛盾的是，GSK-3支持由MLL（混合型白血病）致癌基因引起的一種與眾不同的遺傳性白血病亞型。在一個MLL白血病的小鼠模型中，GSK-3的抑制影響癌症病情的發展，說明它的確是一個候選藥物作用目標。
doi:10.1038/nature07284
Nature vol.455 (7217, 30 Oct 2008) Articles p.1205