Analysis

構造に基づく最大親和性モデルが低分子の創薬可能性を予測する

Nature Biotechnology 25, 1 doi: 10.1038/nbt1273

低分子薬物探索ではリード化合物の創出が大きな問題であり、リード化合物が得られなかったりリード化合物の薬物としての特性最適化が困難であったりするために、プロジェクトの約60%が失敗に終わっている。多大な費用および労力を費やす前に、このような創薬可能性の低い標的を見切ることは有益であろう。本論文では、基本的な生物物理学原則によるモデルを用いた方法で、標的結合部位の結晶構造のみに基づいて創薬可能性が良好に予測されることを示す。薬物様分子で得られる最大親和性を定量的に推定したところ、計算値が薬物探索の成果と相関することが示された。さまざまな化合物のコレクションで高処理能スクリーニングを行い、2種類の予測を実験的に検討した。全体的な結果から、この方法および困難な標的に対処する戦略の有用性が浮き彫りとなった

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