Review

実行可能細胞生物学

Nature Biotechnology 25, 11 doi: 10.1038/nbt1356

生物学的システムの計算モデルは複雑な生物学的挙動の理解を深める研究で重要性を増しつつある。本総説では、生物学的現象の表現が異なる数学的モデルおよび計算モデルという2種類の生物学的モデルの差を明確にする。我々は、生物学的システムの計算モデルを構築する方法を、生物学的現象を模倣する実行可能なコンピューター・アルゴリズムの設計を重視していることから「実行可能生物学」と命名した。本論文では、この方面の主なモデル化研究を調査し、実行可能モデルの生物学研究での応用性および利点を強調するとともに、実行可能生物学が生物学およびコンピューター科学に投げかけるいくつかの問題を明らかにする。生物学的方法の主流として実行可能生物学が可能性を十分に発揮するには、形式的およびアルゴリズム的方法を生物学研究に組み込む必要があると考える。これによって生物学は精度の高い工学的分野に近づくと考えられる。

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