Review

複雑な形質およびヒト疾患の非コード遺伝的変異の解釈

Nature Biotechnology 30, 11 doi: 10.1038/nbt.2422

関連解析は、複雑な疾患の遺伝的基盤に関する全ゲノム的情報をもたらすが、非コード変異の解釈が困難であるため、医学研究は主としてタンパク質をコードする変異に焦点を当ててきた。この図式は、機能的非コード要素の体系的アノテーションの進展とともに変化した。進化的保存、機能ゲノミクス、クロマチン状態、配列モチーフ、および分子的な量的形質遺伝子座はすべて、非コード配列の機能に関する補足情報を提供する。そのような機能地図は、リスクハプロタイプに関して変異体の優先順位をつけ、臨床で遭遇する変異を選別し、システムレベルの解析の実行を支援して、疾患との関連の基礎をなす過程を明らかにすることができる。予測モデルの進歩によってデータセットが統合され、遺伝子座および対立遺伝子の間で共有される経路が解明されて、充実した調節モデルが上位の相互作用の探索を導く。さらに、新しい超並列レポーター実験は、調節の予測が正しいことを体系的に示すことができる。究極的には、調節およびシステムゲノミクスの進歩が、個人レベルのゲノムリスク評価、診断、および治療に向けた全ゲノム配列解読の価値を発揮させると考えられる。

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