効率的な開放型検索エンジンによるタンデム質量スペクトル中のペプチドの網羅的同定

本論文では、共溶出ペプチド、予想外の修飾および消化を含む極めて大きな検索空間中でペプチドを同定するための、配列タグに基づく検索エンジンOpen-pFindを紹介する。この方法は、他の7種類の検索エンジンを上回る精度および速度でペプチドを検出する。Open-pFindによって、4つの大規模データセットにおいてタンデム質量スペクトルの70～85％が同定され、また、1つのヒトプロテオームデータセットにおいてそれぞれ複数のタンパク質固有ペプチドによって支持されるタンパク質1万4064個が同定された。