イムノペプチドームの高度なモチーフ逆畳み込みによるHLAクラスIIエピトープの強力な予測

クラスIIヒト白血球抗原分子（HLA-II）が提示するエピトープの予測が正確性に欠けることから、ワクチンおよび治療法の設計が制限されている。今回我々は、偏りのない質量分析法をモチーフ逆畳み込みアルゴリズムと組み合わせ、HLA-II分子から溶出した合計9万9265個の固有ペプチドに関してプロファイル評価および解析を行った。次に、そのデータを用いてエピトープ予測アルゴリズムを訓練し、病原体および腫瘍に関連するクラスIIネオエピトープの予測を改善した。