細菌およびアーキアのドメインから種までの完全な分類

ゲノム分類データベース（GTDB）は、ゲノムに基づく系統学的に一貫した分類体系であり、ドメインから属までの細菌とアーキアの約15万個のゲノムに関して階級の標準化された分類を示している。しかし、GTDBのゲノムのほぼ40％は種名を持たない。この不具合に取り組むため、我々は、一般に受け入れられている平均ヌクレオチド同一性の基準を用いて種の範囲を設定し、公開されている全ての細菌ゲノムとアーキアゲノムを網羅する種クラスターを提案する。従来の平均ヌクレオチド同一性研究とは異なり、我々はそれぞれの種を定義する命名法上の有効な「タイプ」となる単一の代表ゲノムを選定した。提案する種クラスター2万4706個のうち、8792個は発表済みの学名に基づいている。残りの1万5914個には仮称を割り当て、数を増し続ける未培養種のゲノムに名称を与えた。このリソースは、細菌とアーキアのゲノムに関するドメインから種までの完全な分類学的枠組みとなり、未培養種の研究を促進するとともに科学的成果の伝達を改善すると考えられる。