合成と選択による多重オリゴヌクレオチドライブラリーの精製

複雑なオリゴヌクレオチド（オリゴ）ライブラリーは、合成生物学、製薬、ナノテクノロジー、DNAデータストレージのさまざまな用途に不可欠な材料である。しかし、複雑なオリゴライブラリーの合成はエラー率が高い場合があり、利用のコストと労力の増大につながる。合成エラーには挿入と欠失の誤りによるものが極めて多いことから、我々は、長さが必ずしも同一ではないオリゴを含む複雑なライブラリーを長さに基づいて一塩基の分解能で精製する方法を開発した。MOPSS（multiplex oligonucleotide library purification by synthesis and selection）と称するこの精製法は、逐次的な手作業か次世代シーケンサーの使用のいずれかによって実施できる。同じ長さのオリゴを含みデジタルデータをコードするライブラリーにこの方法を応用したところ、完全長オリゴの純度が83％から97％に高まった。3通りの長さの相補性決定領域H3をコードするライブラリー（実験で到達した多様性 > 10⁶）がワンポットで同時に精製されることも示され、インフレームのオリゴの比率に49.6％から83.5％への改善が見られた。