SLOW5による高速のナノポア塩基配列解読データ解析

ナノポア塩基配列解読法はFAST5ファイル形式に依存しており、効率的な並列解析を行うことができない。本論文で紹介するSLOW5は、ナノポアデータ解析の効率的な並列化および高速化のために設計された新たな形式である。ヒトゲノムのDNAメチル化プロファイリングの例では、一般的な高性能コンピューターで2週間以上を要していた解析時間が約10.5時間まで短縮された。SLOW5はFAST5と比較して約25％小さく、各種のコンピューターアーキテクチャーで一貫して改善を実現する。