Brief Communication

単一細胞トランスクリプトームと空間トランスクリプトームの高分解能アラインメントを行うCytoSPACE

Nature Biotechnology 41, 11 doi: 10.1038/s41587-023-01697-9

単一細胞の空間生物学的特性の重要性が最近の研究で強調されているが、空間トランスクリプトミクスに利用可能なアッセイには、遺伝子回収の不足や空間分解能の低さといった難点がある。本論文では、単一細胞RNA塩基配列解読アトラス由来の個々の細胞を空間的発現プロファイルにマッピングするCytoSPACEという最適化法を紹介する。さまざまなプラットフォームと組織において、CytoSPACEはノイズ耐性と正確度に関して既存の方法よりも優れており、単一細胞分解能での組織地図作製を可能にすることが示された。

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