細胞の空間グラフによる組織中の細胞間コミュニケーションのモデル化

組織中の細胞間コミュニケーションのモデルは解離した細胞の分子プロファイルに基づき、受容体とリガンドのシグナル伝達に限定され、in situでの空間的近接性を無視したものである。本論文ではノード中心の発現モデリングを紹介する。これは、グラフニューラルネットワークに基づき、ニッチ構成による遺伝子発現への影響を空間分子プロファイリングデータから偏りなく推定する方法である。我々は、細胞のコミュニケーションの背後にあることが知られている分子過程のシグネチャーを得た。