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哺乳類トランスクリプトームの一塩基m6Aメチル化の絶対定量を行うGLORI

Nature Biotechnology 41, 3 doi: 10.1038/s41587-022-01487-9

N6-メチルアデノシン(m6A)は哺乳類細胞に最も多いRNA修飾であり、研究が最も進んだエピトランスクリプトーム標識である。m6Aのマッピングにはさまざまなツールが開発されているが、一塩基分解能のm6A絶対定量を可能にする全トランスクリプトーム的な方法は存在しない。今回我々は、グリオキサールおよび亜硝酸塩を介した非メチル化アデノシンの脱アミノ化(glyoxal and nitrite-mediated deamination of unmethylated adenosines;GLORI)を用いて、バイサルファイト塩基配列解読法に基づくDNAの5-メチルシトシンの定量と概念が類似するm6A絶対定量法を開発した。GLORIを用いてマウスおよびヒト細胞のm6Aメチロームを定量すると、分布および化学量論の異なるクラスター化したm6A修飾が見いだされた。また、ストレス下でのm6A動態の特徴を明らかにし、遺伝子発現調節におけるm6A修飾の量的な景観を調べた。GLORIは、m6Aメチロームの絶対定量を偏りなく簡便に行う方法である。

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