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エピジェネティック景観の多因子プロファイリングを単一細胞の分解能で行うMulTI-Tag
Nature Biotechnology 41, 5 doi: 10.1038/s41587-022-01522-9
座位分解能でのクロマチンプロファイリングは細胞タイプや発生経路を規定する遺伝子調節の特徴を明らかにするが、同一試料中の異なるクロマチン結合タンパク質をマッピングして比較することは今なお容易でない。本論文では、クロマチンの複数の特徴のプロファイリングを単一細胞で同時に行う抗体バーコード化法であるMulTI-Tag(Multiple Target Identification by Tagmentation)紹介する。我々は、MulTI-Tagを高い感度と特異性を維持するように最適化し、同一細胞で最大3種類のヒストン修飾(H3K27me3、H3K4me1/2、H3K36me3)を検出することを実証した。MulTI-Tagを応用することにより、異なる細胞タイプと発生経路を見分け、分化の結果に関連する活性因子と抑制因子の調節的利用に関する固有の協調的パターンを識別し、ヒストン標識間の関連性を明らかにした。多因子エピジェネティックプロファイリングは、発生と疾患の細胞特異的な遺伝子調節景観を包括的に解明するものと期待される。