Brief Communication

単一細胞のm6Aマッピングをin vivoで行うpicoMeRIP–seq

Nature Biotechnology 42, 4 doi: 10.1038/s41587-023-01831-7

現在のN6-メチルアデノシン(m6A)マッピング法は、大量のRNAを必要とするか、さもなければ培養細胞に限定されている。我々は、サンプル回収と信号対雑音(SN)比を最適化し、picoMeRIP–seq(picogram-scale m6A RNA immunoprecipitation and sequencing)を開発した。これは、標準的な実験装置を用いて単一細胞や希少な細胞タイプのm6Aをin vivoで調べる方法である。我々は、ポリ(A)RNAの滴定と胚性幹細胞で、また単一のゼブラフィッシュ接合子、マウス卵母細胞および胚において、m6Aマッピングのベンチマーク評価を行った。

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