腸マイクロバイオーム：生後1年間に起こる腸内マイクロバイオームの成熟は、小児喘息を防ぐ農場効果に寄与する

農場での成長は喘息予防効果と結び付けられているが、この効果の基盤にある機序はほとんど知られていない。PASTURE（Protection against Allergy: Study in Rural Environment）出生コホートで、我々は生後2～12か月の幼児のヒト腸内マイクロバイオームの成熟を16S rRNAの塩基配列解読データを使ってモデル化した。12か月齢の幼児での推定マイクロバイオーム年齢（EMA）は、これまでの農場環境への曝露［β = 0.27（0.12～0.43）、P = 0.001、n = 618］や学齢時の喘息リスクの低下［オッズ比（OR）= 0.72（0.56～0.93）、P = 0.011］と関連していた。EMAは農場による防御効果の19％までを仲介していた。我々はコホート内症例対照研究（nested case-control study）の検体（n = 138）で、糞便中酪酸塩の測定値［OR = 0.28（0.09～0.91）、P = 0.034］や酪酸塩産生を予測する細菌群（OR = 0.38（0.17～0.84）、P = 0.017）、酪酸代謝の主要な酵素である酪酸コエンザイムA（CoA）：酢酸CoAトランスフェラーゼをコードする遺伝子の相対的な豊富さ〔OR = 0.43（0.19～0.97）、P = 0.042）が、喘息と逆相関していることを見いだした。腸内マイクロバイオームは、代謝産物を介して喘息予防に関わっていると推定され、ヒトでの腸–肺軸の存在という考え方が裏付けられた。