レジオネラ菌：組換えは感染爆発に関連するレジオネラ菌単離株におけるゲノム進化を加速させる

レジオネラ菌Legionella pneumophilaは、環境中に存在する病原体であり、レジオネラ症の原因菌である。病原体の短期間の進化では非垂直の過程が主要な役割を果たすことが知られているが、環境中の微生物では、非垂直の過程やその他の過程の重要性についてはほとんど分かっていない。我々は単一の場所（スペインのアルコイ）で、11年以上にわたり頻繁に起こる感染爆発に関連した69のレジオネラ菌株の全ゲノム塩基配列決定について報告する。我々は、同じ配列タイプの単離株のゲノム配列と感染爆発の株の配列とは互いにクラスターを形成せず、他の感染爆発からの配列とより近接に関連する例を見いだした。我々の解析により、コアゲノムに検出された98%近くのSNPの原因となる組換えイベント16個、および進化速度の明らかな加速を同定した。これらの結果は、微生物集団の理解や公共衛生介入に関して、レジオネラ菌の感染爆発研究に重要な示唆を与えるものである。