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寄生虫:ブタ鞭虫(Trichuris suis)のゲノムおよびトランスクリプトーム
Nature Genetics 46, 7 doi: 10.1038/ng.3012
鞭虫(Trichuris)は世界で10億人に感染しており、ヒトおよびブタの両方に重大な社会経済的損失をもたらす疾患(鞭虫症)を引き起こす。鞭虫症は、大腸の炎症に関連しており、出血性下痢として出現するが、慢性化すると小児に栄養不良や成長阻害を引き起こすことがある。一方で、これとは対照的に、ブタ鞭虫には期待される効果もあり、炎症性腸疾患(IBD)や多発性硬化症をはじめとするヒト自己免疫疾患での効果が示されている。本論文では、最高140倍のカバー率での雌雄両方の成体ブタ鞭虫(T. suis)の全ゲノム配列決定とおよそ80 Mbの概要配列構築結果を報告する。我々は、mRNAおよび小分子非コードRNAについての生活環、性別および組織に特異的な転写について探索した。