結核菌：結核菌（Mycobacterium tuberculosis）北京系統の進化史と世界的な伝播

結核菌（Mycobacterium tuberculosis）の北京系統株は世界的に分布しており、ユーラシアでの大規模な多剤耐性（MDR）結核の蔓延と関連している。本論文では、99か国の4,987分離株の遺伝学的解析および代表的な110株の分離菌の全ゲノム配列決定により、この北京系統の生物地理的構造と進化史を再構築した。北京系統は極東に最初の起源があり、そこから数回の波をもって世界的に広がった。過去200年にわたる、北京系統の感染集団サイズの増大が経時的に検出された。実際にこれらの増加は、産業革命、第一次世界大戦、HIV流行と同時に起こっていた。北京系統の2つのMDRクローンは、旧ソ連の公的健康保険医療制度の崩壊と同時に、中央アジアおよびロシア全域に伝播し始めた。北京系統では、おそらく正の選択圧下にあり、また毒性に関連する複数の遺伝子変異が同定されたが、それらの変異はこの系統の最も繁栄している分枝の伝播拡大に有利に働いた可能性がある。