Commentary

DataMedを利用して多数の生物医学研究データレポジトリの中から有益なデータを見つける

Nature Genetics 49, 6 doi: 10.1038/ng.3864

生物医学研究のコミュニティーにとって、複数のデータレポジトリをまとめてデータ検索できることの有用性はいうまでもないことだろう。我々は、米国国立衛生研究所(NIH)のBig Data to Knowledgeイニシアチブの一環として、研究者、サービスプロバイダー、ナレッジエキスパートの国際的コミュニティーと連携することにより、さまざまなレポジトリに含まれる各種のデータセットから抽出したメタデータを利用して、データインデックス作成システムおよび検索エンジンの開発やその試行を行っている。DataMedは、科学論文におけるPubMedにあたるものを意図して、データを対象として作られているものだ。DataMedは、データセットの見つけやすさ(findability)とアクセスしやすさ(accessibility)をサポートする。これらは、相互運用性(interoperability)および再利用性(reusability)とともに「FAIR原則」を構成し、今日のビッグデータ集約型の科学におけるナレッジディスカバリー(知識発見)を促進するだろう。

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