Smart-seq3xpressによる全転写物からの拡張性ある単一細胞RNA塩基配列解読

細胞スループットの高い従来の単一細胞RNA塩基配列解読法は全転写物の網羅性を犠牲にしており、感度も犠牲になっていることが多い。本論文で紹介するSmart-seq3xpressは、Smart-seq3のプロトコルを小型化および合理化して試薬の使用量を大幅に削減し、細胞スループットを高めている。末梢血単核細胞のSmart-seq3xpress解析では、一般的な細胞型と希少な細胞型を網羅した詳細なアトラスが得られた。液滴を用いてRNA末端の配列を解読する単一細胞RNA塩基配列解読法と比較すると、高まった全転写物網羅性により、細胞型に関連するアイソフォームの変動が明らかにされた。