Brief Communication

深層データ融合による超解像空間トランスクリプトミクス

Nature Biotechnology 40, 4 doi: 10.1038/s41587-021-01075-3

空間トランスクリプトミクスの既存の方法には、空間解像度が低いという難点がある。本論文では、空間的遺伝子発現データを同じ組織切片の組織学的画像データと組み合わせることによって解像度の高い発現マップを推定する方法を紹介する。深層生成モデルを用いたところ、この方法によってマイクロメートル規模の解剖学的構造のトランスクリプトームが明らかにされ、組織学的画像のみから空間的遺伝子発現を推測することができた。

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