疎なアノテーションからの学習による胚全体の細胞系譜の自動再構築

発生中の全胚のタイムラプス顕微鏡記録から自動的に核を特定して追跡する方法を紹介する。この方法は、ディープラーニングと大域最適化とを組み合わせている。マウスのデータセットでは、1時間で75.8％の細胞系譜が正しく再構築された（競合法では31.8％）。今回の手法は、発生中の胚、組織、および器官の中で細胞の運命が決定される場所とタイミングの解明を促進する。