がんゲノム：前立腺がんのエピジェネティック全体像に関するゲノム全域での生殖細胞系列の相関

発がんは、生殖細胞系列因子、環境因子、確率論的因子によって促進される。これらがどのように相互作用して、腫瘍の分子的表現型を生み出すのかは分かっていない。そこで我々は、589例の限局性前立腺がんの体細胞エピゲノムに対する生殖細胞系列多型の影響を定量化した。素因リスク座位は腫瘍エピゲノムに影響し、がん感受性に対する機構が見つかった。我々は1178の座位を特定し、これらが腫瘍組織でのメチル化変化と関連するが、非悪性組織では関連していないことを立証した。これらの腫瘍メチル化量的形質座位は、クロマチンの構造だけでなく、RNAとタンパク質の存在量にも影響を及ぼす。腫瘍メチル化量的形質座位の重要な1つは、AKT1の発現と関連付けられ、発見コホートと検証コホートの両方で根治的局所治療後の再発を予測した。これらのデータは、生殖細胞系列と原発性腫瘍のエピゲノムとの間の複雑なクロストークを明らかにしており、この結果は、侵襲性の高い腫瘍の生殖細胞系列バイオマーカーを見つけ、患者のトリアージを支援し、より侵襲性の高い、あるいはより高額な診断アッセイの利用を最適化するための手助けとなるだろう。