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大型環状アンチセンスによる高処理能機能ゲノミクスのための遺伝子ノックダウン

2005年5月1日 Nature Biotechnology 23, 5 doi: 10.1038/nbt1089

組換えM13ファージの一本鎖ゲノムDNAをアンチセンス分子として試験し、高処理能機能ゲノミクスでの有用性を評価した。さまざまな遺伝子（TNF-α、c-myc、c-myb、cdk2およびcdk4）のcDNA断片をファージミドベクターに別々にクローン化した。M13バクテリオファージの生活環を利用し、個々の遺伝子のアンチセンスである大型の環状（LC）分子を形質転換細菌の培養上清から調製した。LCアンチセンス分子は安定性および標的特異性が高く、標的部位の探索が不要であった。ここで、肝臓がん組織由来で一方向性のcDNAサブトラクションライブラリーを組み込んだファージミドベクターから作製したLCアンチセンスライブラリーを利用し、高処理能機能ゲノミクスを試みた。がん細胞の増殖に関与する遺伝子は56種類が同定された。この結果は、アンチセンス配列が組換えM13ファージの一本鎖LCゲノムDNAの一部として有効なアンチセンス活性をもっており、高処理能機能ゲノミクスに有望であることを示している。

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