Research Abstract

日本人集団でのゲノムワイド関連解析による7つの新規2型糖尿病疾患感受性座位の同定

Genome-wide association studies in the Japanese population identify seven novel loci for type 2 diabetes

2016年1月28日 Nature Communications 7 : 10531 doi: 10.1038/ncomms10531

ゲノムワイド関連解析(GWAS)により2型糖尿病(T2D)では80以上の疾患感受性座位が同定されているが、その遺伝要因の大部分はいまだ解明されていない。そこで、本研究では、日本人集団におけるT2Dに関するGWASのメタ解析を行った。GWASメタ解析およびその後の検証段階の解析データを統合することで(T2D症例23,399人および対照31,722人)、T2D疾患感受性に関連する新規7座位を同定した(P <5 x 10-8)(CCDC85A近傍のrs1116357、FAM60A内のrs147538848、DMRTA1近傍のrs1575972、ASB3近傍のrs9309245、ATP8B2近傍のrs67156297、MIR4686近傍のrs7107784およびINAFM2近傍のrs67839313)。これらのうち4座位とT2Dとの関連は日本人以外の複数の民族において追試された(最大でT2D症例65,936人および対照158,030人、P <0.007)。これらの結果は、糖尿病などの複雑な形質のGWASの規模拡大を日本人のような遺伝的に均一な民族で行うことは、民族特異的な疾患感受性座位のみならず、異なる民族に共通した新規疾患感受性座位の同定にも有用であることを示している。

Minako Imamura, Atsushi Takahashi, Toshimasa Yamauchi, Kazuo Hara, Kazuki Yasuda, Niels Grarup, Wei Zhao, Xu Wang, Alicia Huerta-Chagoya, Cheng Hu, Sanghoon Moon, Jirong Long, Soo Heon Kwak, Asif Rasheed, Richa Saxena, Ronald C. W. Ma, Yukinori Okada, Minoru Iwata, Jun Hosoe, Nobuhiro Shojima, Minaka Iwasaki, Hayato Fujita, Ken Suzuki, John Danesh, Torben Jørgensen, Marit E. Jørgensen, Daniel R. Witte, Ivan Brandslund, Cramer Christensen, Torben Hansen, Josep M. Mercader, Jason Flannick, Hortensia Moreno-Macías, Noël P. Burtt, Rong Zhang, Young Jin Kim, Wei Zheng, Jai Rup Singh, Claudia H. T. Tam, Hiroshi Hirose, Hiroshi Maegawa, Chikako Ito, Kohei Kaku, Hirotaka Watada, Yasushi Tanaka, Kazuyuki Tobe, Ryuzo Kawamori, Michiaki Kubo, Yoon Shin Cho, Juliana C. N. Chan, Dharambir Sanghera, Philippe Frossard, Kyong Soo Park, Xiao-Ou Shu, Bong-Jo Kim, Jose C. Florez, Teresa Tusié-Luna, Weiping Jia, E Shyong Tai, Oluf Pedersen, Danish Saleheen, Shiro Maeda & Takashi Kadowaki

Corresponding Authors

前田 士郎
琉球大学大学院医学研究科先進ゲノム検査医学講座
琉球大学附属病院検査・輸血部
理化学研究所 統合生命医科学研究センター 腎・代謝・内分泌疾患研究チーム

門脇 孝
東京大学大学院 医学系研究科 代謝・栄養病態学

Genome-wide association studies (GWAS) have identified more than 80 susceptibility loci for type 2 diabetes (T2D), but most of its heritability still remains to be elucidated. In this study, we conducted a meta-analysis of GWAS for T2D in the Japanese population. Combined data from discovery and subsequent validation analyses (23,399 T2D cases and 31,722 controls) identify 7 new loci with genome-wide significance (P<5 × 10−8), rs1116357 near CCDC85A, rs147538848 in FAM60A, rs1575972 near DMRTA1, rs9309245 near ASB3, rs67156297 near ATP8B2, rs7107784 near MIR4686 and rs67839313 near INAFM2. Of these, the association of 4 loci with T2D is replicated in multi-ethnic populations other than Japanese (up to 65,936 T2Ds and 158,030 controls, P<0.007). These results indicate that expansion of single ethnic GWAS is still useful to identify novel susceptibility loci to complex traits not only for ethnicity-specific loci but also for common loci across different ethnicities.

「おすすめのコンテンツ」記事一覧へ戻る

プライバシーマーク制度