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ハクサイのゲノム:中倍数体作物種Brassica rapaのゲノム

Nature Genetics 43, 10 doi: 10.1038/ng.919

ハクサイ、Brassica rapaアクセションChiifu-401-42の概要ゲノム配列のアノテーションおよび解析を行った。かつてゲノム三重複が起こったB.rapaのゲノムには、タンパク質をコードする遺伝子が41,174個確認された。外群としてArabidopsis thaliana(シロイヌナズナ)を用い、構造および機能の進化など、ゲノム三重複の影響を検討した。三重複ゲノムは区分ごとに遺伝子喪失(細分化)の程度が異なり、祖先が持っていたと考えられる遺伝子の特別に大きな断片が、必ず3コピーの中の1コピーに保持されている。ゲノムに存在する遺伝子ファミリーの要素数の差は、Brassica種の著明な形態的柔軟性に寄与している可能性がある。このB.rapaゲノム配列は、倍数体ゲノムの進化を研究するための重要な資源となり、Brassicaの油脂および野菜作物の遺伝的改良を後押しするものである。

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