Article 21,243個のヒト完全長cDNAの塩基配列決定 2004年1月1日 Nature Genetics 36, 1 doi: 10.1038/ng1285 ヒトのトランスクリプトームと機能ゲノミクスの基盤として、我々は全長塩基配列を決定した多数のcDNAを収集し、’完全長−長鎖−日本’（FLJ）cDNAコレクションを作成した。21,243個のクローンを選択しその塩基配列を決定した結果、14,490種類（10,897クラスター）がFLJにのみ存在するクローンであった。そのうちの約半分（5,416）のクローンはタンパク質をコードしていた。1,999種類はコンピュータ解析では予測できないものであった。予測されなかったcDNAのGC含量の分布の山はおよそ58%のところにあり、すでに予測されたcDNAのGC含量の分布の山はおよそ42%であった。これらの結果から、現在の遺伝子予測プログラムはGC含量の高いものを多少予測しにくい傾向があると考えられた。残りのFLJコレクションのみにある配列（5,481）は、明らかな開いた読み枠（ORF）がなく、非コードRNA（noncoding RNA）の候補と考えられた。約4分の1（1,378）は、明らかなスプライシングパターンを示していた。非コードcDNAのGC含量の分布幅は狭く、その山はおよそ42％のところにあり、これはタンパク質をコードするcDNAに比して低い値である。 Full text PDF 目次へ戻る
