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SMYD3 の5’ 側領域にあるE2F-1結合部位の反復配列（VNTR）多型はヒトがんの危険因子である

2005年10月1日 Nature Genetics 37, 10 doi: 10.1038/ng1638

ヒストン修飾は転写調節の重要なステップであり、その修飾の調節過程の崩壊は、ヒトのがん化において重要である。我々はすでに、ヒストンメチルトランスフェラーゼであるSMYD3の発現上昇が、ヒトの大腸がんおよび肝細胞がんの細胞増殖を促進していることを報告した。本論文では、SMYD3の調節領域にあるCCGCC単位の3回繰り返しをもつ対立遺伝子のホモ接合性が、大腸がん（P=9.1x 10^-6, オッズ比=2.58）、肝細胞がん（P= 2.3x 10^-8、オッズ比=3.50）、乳がん（P=7.0 x 10^-10、オッズ比= 4.48）の高リスクと関連することを報告する。この反復配列は、転写因子であるE2F-1の結合部位にあたる。レポーターアッセイにおいて、この結合モチーフの反復が3回のプラスミド（高リスク対立遺伝子に対応）は、反復が2回のプラスミド（低リスク対立遺伝子）よりも、高い活性を示した。これらのデータから、SMYD3においてよく見られる反復配列（VNTR）の多型が、いくつかの種類のヒトのがんにおける危険因子であることが示された。

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