Letter 心臓、肺、血液疾患のラットモデルに関する生理学的ゲノム科学リソース 2006年2月1日 Nature Genetics 38, 2 doi: 10.1038/ng1693 心血管系疾患は、遺伝的要因と環境的要因によって影響を受ける。TIGRげっ歯類発現ウェブ資源（TREX）は、2200のマイクロアレイハイブリダイゼーションデータからなり、18種類のラット系統由来の800以上もの動物を含んでいる。これらの系統は、遺伝学的に多様な親に由来し、食塩感受性Dahlラット（SS/JrHsdMcwi）の遺伝的背景のなかに、正常血圧Brown Norwayラット（BN/NHsdMcwi）の各染色体を導入した染色体置換パネル系統を含んでいる。これらの動物の両性について、2つの環境的条件（正常酸素状態、低酸素状態）における、4つの組織（心臓、肺、肝臓、腎臓）での発現変化を示すプロファイルが記録されている。このプロファイルの解釈が、ほぼ400の高品質の直接比較（レプリカは含まない）と10000を超えるペアワイズ比較にもとづいて説明される。染色体置換系統の各個体がもつゲノムは、親のゲノムと平均5％以下の違いしかなく、複雑な形質を解析し原因遺伝子を同定するのに役に立つものである。我々は、プロファイルについて多くのデータマイニングをおこない、PhysGenリソースから補足的な生理学的データを用いており、心血管系研究者がどのようにすれば仮説を作り出す目的でTREXを利用できるかを本論文に示した。 Full text PDF 目次へ戻る
