Technical Report

関連解析：関連解析のためのゲノムワイド効率的混合モデル関連解析

2012年7月1日 Nature Genetics 44, 7 doi: 10.1038/ng.2310

線形混合モデルは、遺伝子関連解析において、集団の階層化と近縁性を扱う強力で効果的なツールとして最近、大いなる関心を集めている。しかし、現在ある手法は、中規模のゲノムワイド関連解析であっても、標準検定統計量を厳密に計算するにはコンピューターの能力からみて非現実的である。この問題を解決するために、いくつかの近似的な手法が提案されてきた。今回、私たちはゲノムワイド効率的混合モデル関連（genome-wide efficient mixed-model association：GEMMA）と呼ぶ、効果的かつ厳密な手法を示す。この手法は、多くの場面で近似を不要にするものである。また、nをサンプルサイズとしたときに、効率的混合モデル関連（efficient mixed-model association：EMMA）として知られている、広く用いられている厳密な手法よりも、さらに約n倍速く、その結果、厳密なゲノムワイド関連解析を大量の個人や個体数に適用するのにコンピューターの性能的に実用的なものとなるのである。

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