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乳がんと卵巣がん:TERT座位の独立した複数の多型がテロメアの長さおよび、乳がんと卵巣がんのリスクと関連する
Nature Genetics 45, 4 doi: 10.1038/ng.2566
TERT座位の複数のSNPと白血球のテロメアの長さは、多くのがんのリスクと関連していることが報告されている。イルミナ社のカスタム遺伝子型タイピングアレイiCOGSを使って、乳がん(n=103,991)、卵巣がん(n=39,774)、BRCA1変異を持つがん患者(n=11,705)、および対照群のTERT座位で、約480のSNPを解析した。白血球テロメアの計測も53,724人で可能であった。ほとんどの関連は3つの独立したピークに集まっている。ピーク1のSNP rs2736108のマイナー対立遺伝子は、長いテロメア長(P=5.8 × 10−7)、エストロゲン受容体(ER)陰性(P=10 × 10−8)とBRCA1変異を持つ乳がん患者(P=1.1 × 10−5)のより低いリスク、プロモータアッセイシグナルの変化と関連していた。ピーク2 SNP rs7705526のマイナー対立遺伝子は、長いテロメア(P=2.3 × 10−14)、潜在的に悪性度の低い卵巣がんの高いリスク(P=1.3 × 10−15)、高いプロモータ活性と関連を示した。ピーク3のSNP rs10069690とrs2242652のマイナー対立遺伝子は、ER陰性(P=1.2 × 10−12)乳がん、BRCA1変異を持つ乳がん(P=1.6× 10−14)と侵襲性卵巣がん(P=1.3 × 10−11)のリスクを高めるが、それはテロメア長の変化によるものではなかった。がんのリスク対立遺伝子であるrs2242652とrs10069690は、サイレンシングの増強と短いTERTスプライシングバリアントの産生にそれぞれ関連していた。