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魚類プラティのゲノム：プラティ（Xiphophorus maculatus）のゲノムが進化的適応および複数の複雑な形質を明らかにする

2013年5月1日 Nature Genetics 45, 5 doi: 10.1038/ng.2604

複雑な行動や胎生、がんをはじめとする悪性疾患など、根拠があるわけではないが哺乳類の典型的な特徴と一般的に考えられている属性の中には、下等な脊椎動物にも独立して認められている例が複数存在する。そうした複雑な形質の進化の基礎となる遺伝的メカニズムはほとんど明らかにされていない。プラティ（X. maculatus）は、そのような形質に関する分子生物学的理解を深めるための特別なモデルとなる魚類である。本論文では、プラティゲノムの塩基配列を決定した結果を示す。組み立てたゲノムを大規模な遺伝子地図と組み合わせることにより、哺乳類と比較して魚類の染色体は予想外の進化的安定性を持つことが明らかになった。胎生と関係する遺伝子には正の選択の特徴が認められ、新たな推定上の機能ドメインおよび平行進化の希少な例が明らかにされた。また、認知に関与する遺伝子では、この硬骨魚類のゲノムに重複が生じた後で、重複遺伝子が意外なほどの高率で維持されていることもわかり、両生類および爬虫類をしのぐ行動的複雑性が魚類で進化したという仮説が示唆された。

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