非コード領域：がんにおける非コード領域の調節配列変異についてのゲノムワイド解析

がんは主として、ゲノムに生じた体細胞性変化のために起こる。塩基配列決定技術が進歩したことにより、さまざまな種類のがんが大規模に配列解読されるようになり、タンパク質をコードしている遺伝子の変異の同定が盛んに行われている。だが、タンパク質をコードするエクソームは、ヒトゲノムの2%未満を占めるにすぎない。本論文では、がんゲノムアトラスやその他のプロジェクトから得られた863種類のヒト腫瘍の完全ゲノム配列を解析し、がんにおいて高い頻度で変異が生じている非コード領域を徹底的に探した。今回、変異の出現頻度および配列を基にした新たな手法を用いて、遺伝子発現の調節に影響を与え得る非コード配列変異の有無についてゲノムを網羅的に調べた。この方法により、PLEKHS1、WDR74、SDHDの上流調節エレメントに頻発する変異を同定し、また、TERTのプロモーター領域には既知の変異を同定した。SDHDプロモーターの変異はメラノーマで頻度が高く、遺伝子発現の低下と予後不良に関連を示した。タンパク質をコードしていない領域のがんゲノムについてはかなりの部分が依然として未解明であるが、今回の研究成果は、がんの治療を目指してゲノム全体を解析対象とする研究努力の一歩だといえる。