DNAメチル化：後期複製ドメインのDNAメチル化の消失は有糸分裂に関係する

DNAメチル化の消失はがんゲノムでしばしば見られ、主に、部分的メチル化ドメイン（PMD）と呼ばれる、後期に複製するラミナ結合領域内に起こることが多い。本論文では、全ゲノムバイサルファイト塩基配列決定法（WGBS）を用いて、39のさまざまな原発性腫瘍、およびそれと対応する8の隣接組織のプロファイリングを行い、さらにこれらのデータを、343のヒトおよび206のマウスのWGBSデータセットと共に解析した。その結果、PMDの優先的低メチル化に関連する局所のCpG塩基配列文脈（context）が突き止められた。この文脈（「solo-WCGW」と命名した）でのCpGを解析したところ、健康な組織タイプのほぼ全てにおいて、これまでに検出されていなかったPMDの低メチル化が同定された。PMD低メチル化は、胎児発生過程で開始し、加齢とともに上昇しており、細胞分裂の累積をたどっているように見えた。がんでは、PMD低メチル化の程度は、体細胞変異密度や細胞周期遺伝子発現と相関し、その有糸分裂の履歴を反映することから、有糸分裂時計として利用できると考えられた。我々は、後期の複製が、生涯にわたって徐々にメチル化を消失させており、これが細胞老化のバイオマーカーとして機能して、発がんに関与する可能性があることを提唱する。