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がん転移:転移性乳がんのゲノム全体像が明らかにする、変異とシグネチャーの頻度の変化
Nature Genetics 51, 10 doi: 10.1038/s41588-019-0507-7
442人の転移性乳がん患者から、前向き研究として集められた組織生検について全ゲノム塩基配列決定を行い、原発性乳がんと比較して、転移性乳がんでは腫瘍変異量が2倍になっており、変異シグネチャーの相対的関与量が変化し、既知の6つのドライバー遺伝子の変異頻度が増加していることを明らかにした。また、前治療との有意な関連性も観察された。例えば、変異シグネチャー17の関与はフルオロウラシル、タキサン、プラチナ製剤、および/あるいはエリブリンの前治療を受けた患者で有意に高まっていた。また、本研究で特定されたde novo変異シグネチャーのうちの、シグネチャーIは、プラチナ製剤による化学療法を含む前治療と有意に関連していた。臨床的関連性のある腫瘍サブグループが見つかり、それらは、相同組換え異常(13%)、高い腫瘍変異量(11%)、FDA承認薬への感受性と結び付いた特異的な変異(24%)のいずれかを示した。この研究は、転移性乳がんの生物学的性質に関する知見をもたらし、将来的に患者管理の改善に役立つ臨床的に有用なゲノム特性を明らかにしている。