加齢黄斑変性症：網膜のトランスクリプトーム解析およびeQTL解析から加齢黄斑変性症に関連する遺伝子が同定される

ゲノムワイド関連解析（GWAS）から、加齢黄斑変性症（AMD）に関与する34座位の遺伝的バリアントが同定されている。本論文では、病期が異なるAMD症例と対照を合わせた453例について、死後網膜の転写プロファイルを作成して、網膜トランスクリプトームにまとめた。これには、1万3662のタンパク質コード遺伝子と1462の非コード遺伝子に加え、900万以上のありふれたSNPの遺伝子型が含まれている。これらのSNP遺伝子型は、組織ごとの発現量的形質座位（eQTL）解析に用いることができるデータで、GTEx（Genotype-Tissue Expression）や他の大規模なデータセットには含まれていない。cis-eQTL解析から、遺伝的に調節されている1万474遺伝子が同定され、この中には網膜においてのみ検出される4541のeQTLが含まれていた。AMD-GWASとeQTLの統合解析から、すでに報告されている6座位での候補標的遺伝子を確認することができた。トランスクリプトーム規模の関連解析（TWAS）を用いて、ボンフェローニ補正後にさらに3つの遺伝子RLBP1、HIC1、PARP12を同定した。我々の研究はAMDの遺伝的全体像に関する情報を拡充するものであり、我々が構築したEyeGEx（Eye Genotype Expression）データセットが、眼に関する多因子性形質のGWAS後解釈に有用な情報源であることを実証するものである。