卵巣がん：高悪性度漿液性上皮性卵巣がんのトランスクリプトームワイド関連研究から明らかになった、新たな感受性遺伝子とスプライシングバリアント

今回我々は、高悪性度漿液性上皮性卵巣がん（HGSOC）に対する感受性遺伝子を特定する試みとして、HGSOCに関連した組織タイプ（N = 2,169）と、利用可能な最大のHGSOCゲノムワイド関連研究（症例群N = 13,037、対照群N = 40,941）に対して、遺伝子発現とスプライス部位利用についてのトランスクリプトームワイド関連研究を行った。このトランスクリプトームワイド関連研究では、有意な関連を示した25の遺伝子が同定された。そのうち7つはスプライス部位レベルでのみの比較であり、19q21.32のLRRC46（P = 1 × 10⁻⁹）、8q21のCHMP4C（P = 2 × 10⁻¹¹）、15q26のPRC1のスプライス部位（P = 7 × 10⁻⁹）が含まれていた。CHMP4Cに対するin vitroアッセイでは、HGSOC関連バリアントが対立遺伝子特異的なエキソンインクルージョンを誘導することが分かった（P = 0.0024）。HGSOC細胞株における機能スクリーニングでは、我々が見いだした新たな3つの遺伝子（HAUS6、KANSL1およびPRC1）が必須の遺伝子であることを示す証拠が得られた（特にPRC1はMYCと同等である）。ゲノムワイド関連研究で関連が見つかった13領域のうちの6つからは、それぞれ少なくとも1つの標的遺伝子が見つかり、23の新たなHGSOC感受性遺伝子候補を特定することができた。