転写調節：神経細胞におけるシス調節性クロマチン接触のマッピングにより、神経精神疾患リスクバリアントと標的遺伝子とを結び付ける

遺伝子の調節配列の変異は、幅広い複雑な神経精神疾患と関連する。しかし、それらの細胞タイプには特異性があり、また、調節配列の標的を解析することが難しいため、原因となる遺伝的バリアントを特定する能力は限られている。我々はこのような制約に取り組むために、機能的に異なる4つの神経細胞タイプ〔誘導多能性幹細胞（iPSC）から誘導した興奮性ニューロンと下位運動ニューロン、iPSC由来の海馬歯状回様ニューロン、初代アストロサイト〕において、クロマチン相互作用、オープンクロマチン領域、トランスクリプトームの3つについて総合的な解析を行った。用いた方法は、それぞれプロモーターキャプチャーHi-C法、ATAC-seq（assay for transposase-accessible chromatin with high-throughput sequencing）法、RNA塩基配列決定法である。その結果、プロモーターと遠位プロモーター相互作用領域の間に数10万カ所の長距離シス相互作用が特定されたことで、調節配列をそれらの標的遺伝子と結び付け、疾患で調節異常になると推定される過程を明らかにできるようになった。さらに、CRISPR（clustered regularly inter-spaced short palindromic repeat）技術を用いて、ヒトの興奮性ニューロンにおけるいくつかのプロモーター相互作用領域を検証し、CDK5RAP3、STRAP、DRD2が、物理的に結び付いたエンハンサーにより転写的に調節されることを明らかにした。