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3Dゲノミクス:BRD2は接近可能なゲノムを区画化する

Nature Genetics 54, 4 doi: 10.1038/s41588-022-01044-9

哺乳類の染色体はメガ塩基サイズに区画化されており、こうした区画はさらに小さなトポロジカルドメイン(TAD)に区画化される。TADの形成はコヒーシンに依存しているが、区画化の背景となる機構は明らかになっていない。本論文では、コヒーシンが喪失すると、BET(bromodomain and extraterminal)ファミリーの足場タンパク質BRD2が活性クロマチンの空間的混合と区画化を促進することを示す。この活性は転写とは独立しているが、BRD2は2つのブロモドメインを介してアセチル化された標的を認識し、低複雑性(LC)ドメインによって結合相手分子と相互作用する必要がある。特に、BRD2を介したゲノム区画化は、一方ではコヒーシン、他方ではBETホモログタンパク質のBRD4に拮抗し、このどちらもがBRD2のクロマチンへの結合を阻害する。我々のポリマーシミュレーションのデータから、ゲノムの区画化はループ突出とクロマチン状態特異的な親和性相互作用の間の競合から生じるという、核トポロジーのBRD2–コヒーシン相互作用モデルが裏付けられた。

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