遺伝学：太平洋地域の人類集団の祖先を読み解く
Nature
太平洋地域の人類集団史の詳細な分析について報告する論文が、今週、Nature に掲載される。今回のゲノム研究は、ヒトの進化、ヒト族の異種交配、そして島嶼環境での生活に応じて起こる適応に関して新たな知見をもたらした。
太平洋地域は、パプアニューギニア、ビスマルク諸島、ソロモン諸島を含む「近オセアニア」と、ミクロネシア、サンタクルーズ、バヌアツ、ニューカレドニア、フィジー、ポリネシアを含む「遠オセアニア」に分けられる。人類は、アフリカから移動した後、約4万5000年前に近オセアニアに定住した。遠オセアニアに人類が定住したのは、それよりずっと後の約3200年前のことで、現在の台湾からの移住だった。
この人類集団史をさらに探究するため、Lluis Quintana-Murci、Etienne Patinたちの研究チームは、太平洋地域に分布する20集団のいずれかに属する現代人317人のゲノムを解析した。その結果、近オセアニア集団の祖先の遺伝子プールが、この集団が太平洋地域に定住する前に縮小し、その後、約2万～4万年前にこの集団が分岐したことが判明した。それからずっと後、現在の台湾から先住民族が到来した後に、近オセアニア集団の人々との混合が繰り返された。
太平洋地域の集団に属する人々は、ネアンデルタール人とデニソワ人の両方のDNAを持っている。デニソワ人のDNAは複数回の混合によって獲得されたもので、これは、現生人類と古代ヒト族との混合が、アジア太平洋地域で一般的な現象だったことを示している。ネアンデルタール人の遺伝子は、免疫系、神経発生、代謝、皮膚色素沈着に関連した機能を備えているが、デニソワ人のDNAは主に免疫機能と関連している。そのため、デニソワ人のDNAは、太平洋地域に初めて定住した者が、その地域で蔓延していた病原体と闘うために役立つ遺伝子の供給源となり、島嶼環境の新たな居住地に適応するために役立った可能性がある。
A detailed analysis of the population history of the Pacific region is revealed in this week’s Nature. The genomic study sheds light on human evolution, mixing between species of hominins, and the adaptations that occur in response to living in island environments.
The Pacific region can be divided into Near Oceania, which includes Papua New Guinea, the Bismarck archipelago and the Solomon Islands, and Remote Oceania, which includes Micronesia, Santa Cruz, Vanuatu, New Caledonia, Fiji and Polynesia. After humans migrated out of Africa, they settled in Near Oceania around 45,000 years ago. Remote Oceania was populated much later, around 3,200 years ago, which involved people journeying from what is now Taiwan.
To further explore this history, Lluis Quintana-Murci, Étienne Patin and colleagues analysed the genomes of 317 present-day individuals from 20 populations spread across the Pacific region. Their finds reveal that the gene pool of the ancestors of Near Oceanian individuals was reduced before they settled in the region, and that the populations then diverged around 20,000 to 40,000 years ago. Much later, after Indigenous peoples from what is now Taiwan arrived, there were recurrent episodes of admixture with the Near Oceanian populations.
Individuals from Pacific populations also bear DNA from both Neanderthals and Denisovans. The Denisovan DNA was acquired across multiple bouts of admixture, indicating that mixing between modern humans and archaic hominins was a common phenomenon in the Asia-Pacific region. The Neanderthal genes are associated with functions related to the immune system, neural development, metabolism and skin pigmentation, whereas the Denisovan DNA is mainly implicated in immune functioning. As such, it could have provided a reservoir of genes that helped the original settlers to combat local pathogens, helping them to adapt to their new island homes.
After the embargo ends, the full paper will be available at: https://www.nature.com/articles/s41586-021-03236-5
doi: 10.1038/s41586-021-03236-5
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