希少変異：希少バリアントの関連解析のための遺伝子レベルの検定のメタ解析

一般的な遺伝的バリアントと複雑な疾患との関連性は、大部分がメタ解析により同定され報告されてきた。メタ解析は、大きなサンプルサイズのデータの利用を可能にし、集団構造の問題や、個人レベルのデータを共有する小サンプルセット解析の反復の問題を防ぐ有用な手法である。遺伝的な関連解析の主眼が希少なバリアントに移るに従って、遺伝子と他の機能ユニットが解析の中心になってきている。今回、我々は希少バリアント関連検定のメタ解析を行うための新しいアプローチについて提案し、その評価をした。ここには、遺伝的荷重検定、重み付き遺伝的荷重検定、可変閾値検定および逆の作用のバリアントを一緒にグループ化するのを可能にする検定が含まれている。我々のアプローチは単一バリアントについてのメタ解析アプローチの有用な特徴をそのまま保持しており、エキソームアレイにより遺伝子型決定されたおよそ18,500人における血液の脂質レベルに関する研究でこの手法が実際に用いられている。