変異の制約：変異の制約を用いてヒトの短鎖縦列反復配列の多様性を解釈する

変異が存在しないゲノム領域を同定することにより、有害な可能性のあるバリアントを識別できる。短鎖縦列反復配列（STR）は、マイクロサテライトとしても知られており、ヒトではde novo変異に最も多く関与している。しかし、座位当たりのSTR変異研究は、確認の頻度が高い数十座位に限られている。本論文では、バイオインフォマティクスのツールと新しい解析方法を利用して、STR遺伝子型を局所の配列のヘテロ接合性と相関させることで、ヒトゲノムの各STRの変異パラメーターを見積もった。我々の方法を適用して、局所の配列の特徴が変異パラメーターに及ぼす影響についてのロバストな推定値を得て、これらの推定値を用いて、観察された変異率と予測された変異率を比較することで、STRの制約を測定する方法を作り出した。制約スコアから、早発性の効果を持つ既知の病因性バリアントが突き止められた。我々の指標は、遺伝医学研究において病因性STRの優先順位付けを行うための有益なツールになると考えられる。