乳がん：乳がんにおけるグアニン四重鎖DNA構造領域の全体像

抗がん剤治療に対する応答や抵抗性が多様であるのは、腫瘍間および腫瘍内の不均一性のためである。本論文では、22人の乳がん患者由来腫瘍異種移植片（PDTX）モデルで、エンリッチメント解析の結果に差が見られるグアニン四重鎖（G4）DNA構造形成領域（ΔG4R）をマッピングした。∆G4Rは、高発現を示す高度に増幅された遺伝子のプロモーター、および体細胞性の一塩基バリアントに関連を示した。ΔG4R全体像の差異から、PDTXにおける7つの転写因子プログラムが明らかになった。∆G4Rの豊富さとその位置によって、PDTXはG4に基づく少なくとも3つのサブタイプに層別化された。ほとんどのPDTX（22のうちの14）の∆G4Rは、2つ以上の乳がんサブタイプ〔統合クラスター（IC）と呼ぶ〕と関連していることが分かった。このことから、PDTXモデル内の複数の乳がん状態の共存はよく見られることであり、その大部分はアグレッシブなトリプルネガティブIC10遺伝子活性を示すことが示唆された。∆G4Rレベルが上昇したPDTXモデルを短期培養すると、G4 DNAを標的とする低分子への感受性が高いことが分かった。従って、G4の状態からPDTX生検に見られるさらなるIC関連腫瘍内不均一性が明らかになり、乳がんの層別化が改善され、新しい治療戦略を見つけられる可能性がある。