遺伝学：アフリカ系女性の乳がんリスクに関連する遺伝的バリアントが特定された
Genetics: Genetic variants for breast cancer risk in women of African ancestry identified
doi: 10.1038/s41588-024-01736-4
Volume 52 Number 9
ヨーロッパのトウモロコシゲノム
ヨーロッパの気候が温暖な地方でのトウモロコシ栽培には、早生で、寒さに強い在来のフリント種が重要な役割を果たしてきた。Habererたちは、ヨーロッパのフリント種4種と北米のデント種2種のトウモロコシ系統について、コアゲノム領域と必須ではないゲノム領域を詳しく調べることにより、2つの遺伝資源間の相違点を解き明かした。ハプロタイプの著しいバリエーションやヘテロクロマチンノブ、オルソロガスなLTR型レトロトランスポゾンにより、トウモロコシゲノム特有の進化動態が明らかになった。
参照論文：Haberer et al Article p. 950
画像制作：Tom Freudenberg/pict-images and Technical University of Munich
表紙デザイン：Erin Dewalt
目次
注目のハイライト
遺伝学：大麻使用障害の遺伝学的解析
Genetics: Genetics of cannabis use disorder
doi: 10.1038/s41588-023-01563-z
Editorial
作物ゲノムとその未来
Crop genomes and beyond p.865
doi: 10.1038/s41588-020-0691-5
News & Views
エピゲノミクス：ポリコームの謎を解く
RNA closing the Polycomb circle p.866
doi: 10.1038/s41588-020-0683-5
トランスクリプトミクス：RNAの転写後修飾がクロマチンに働きかける
RNA post-transcriptional modification speaks to chromatin p.868
doi: 10.1038/s41588-020-0685-3
Letters
トランスクリプトミクス：N6-メチルアデノシンはヒストンH3K9me2の脱メチル化を共転写的に指示する
N6-Methyladenosine co-transcriptionally directs the demethylation of histone H3K9me2 p.870
doi: 10.1038/s41588-020-0677-3
乳がん：乳がんにおけるグアニン四重鎖DNA構造領域の全体像
Landscape of G-quadruplex DNA structural regions in breast cancer p.878
doi: 10.1038/s41588-020-0672-8
テロメアクライシス：テロメアクライシスの際のAPOBEC3依存性カタエギス（kataegis）とTREX1による染色体粉砕
APOBEC3-dependent kataegis and TREX1-driven chromothripsis during telomere crisis p.884
doi: 10.1038/s41588-020-0667-5
染色体外DNA：染色体外DNAは多様ながんでがん遺伝子増幅および予後不良と関連している
Extrachromosomal DNA is associated with oncogene amplification and poor outcome across multiple cancers p.891
doi: 10.1038/s41588-020-0678-2
Articles
がんゲノム：機械学習と集団遺伝学を用いた腫瘍のサブクローン再構築
Subclonal reconstruction of tumors by using machine learning and population genetics p.898
doi: 10.1038/s41588-020-0675-5
前立腺がん：一細胞トランスクリプトミクスで明らかになった、前立腺陥入の遠位末端に特有の管腔前駆細胞タイプ
Single-cell transcriptomics identifies a distinct luminal progenitor cell type in distal prostate invagination tips p.908
doi: 10.1038/s41588-020-0642-1
胃がん：エプスタイン・バーウイルス陽性胃がんにおける種間クロマチン相互作用が誘導する転写再構成
Cross-species chromatin interactions drive transcriptional rewiring in Epstein–Barr virus–positive gastric adenocarcinoma p.919
doi: 10.1038/s41588-020-0665-7
エピジェネティクス：RNAはヒト多能性幹細胞におけるPRC2のクロマチン占有と機能に必須である
RNA is essential for PRC2 chromatin occupancy and function in human pluripotent stem cells p.931
doi: 10.1038/s41588-020-0662-x
トランスクリプトミクス：遺伝的解析からヒト疾患の遺伝率にmRNAのN6-メチルアデノシン（m6A）修飾が関与することが裏付けられた
Genetic analyses support the contribution of mRNA N6-methyladenosine (m6A) modification to human disease heritability p.939
doi: 10.1038/s41588-020-0644-z
トウモロコシ：ヨーロッパのトウモロコシゲノムは反復配列と遺伝子構成についての種内多様性に特徴がある
European maize genomes highlight intraspecies variation in repeat and gene content p.950
doi: 10.1038/s41588-020-0671-9
Analysis
がん/超変異：DNAミスマッチ修復はヒトがんにおいてAPOBEC3が仲介する広範な超変異（diffuse hypermutation）を促進する
DNA mismatch repair promotes APOBEC3-mediated diffuse hypermutation in human cancers p.958
doi: 10.1038/s41588-020-0674-6
Technical Report
レアバリアント：複数のin silico機能アノテーションを動的に組み込むことで、大規模な全ゲノム塩基配列決定研究のレアバリアント関連解析の検出力を向上させる
Dynamic incorporation of multiple in silico functional annotations empowers rare variant association analysis of large whole-genome sequencing studies at scale p.969
doi: 10.1038/s41588-020-0676-4
