クロマチン動態：液体クロマチンHi-C法により区画依存性のクロマチン相互作用動態の特徴を明らかにする

活性なクロマチンと不活性なクロマチンが核内で区画化されることは、同様のタイプの座位間の相互作用による微細相分離を介して起こると考えられている。しかし、これらの相互作用の性質や動態は明らかにされていない。本論文で、我々は、液体クロマチンHi-C（liquid chromatin Hi-C）法を開発し、座位間の相互作用の安定性をマッピングした。染色体を断片化し、重合体としての強い制約を取り除いた後に、固定とHi-C法を行うことで、本来の座位–座位相互作用の安定性を検出することができる。断片が10～25 kbより大きい場合、区画は安定である。クロマチンが6 kb未満に断片化されると、ゲノムの構造が徐々に喪失する。ラミン関連ドメインは最も安定であるが、スペックル関連座位とポリコーム関連座位の相互作用はそれよりも動的である。コヒーシンを介したループは、断片化後に解消される。液体クロマチンHi-C法は、染色体の相互作用動態のゲノム規模の概観を示してくれる。