パンデミック規模のゲノムデータセットから系統を推定する

ゲノム塩基配列の大規模なコレクションから系統樹を再構築することは、計算上困難な課題である。我々は、大量の近縁ゲノムの系統推定を行う方法であるMAPLE（maximum parsimonious likelihood estimation：最大節約・最尤推定）を開発した。重症急性呼吸器症候群コロナウイルス2（SARS-CoV-2）や今後のパンデミック（世界的大流行）の感染性病原体の進化や拡散を研究する際に有用な方法となるだろう。