遺伝：HIVがニューヨーク市に上陸した時期
Nature
ヒト免疫不全ウイルス（HIV-1）が1970年前後にカリブ海地域からニューヨーク市へ「ひとっ飛び」して、その後の北米での流行の引き金になったことを報告する論文が、今週掲載される。今回の研究は、歴史的分析とゲノム解析を組み込んだものであり、“Patient Zero（患者0号）”と誤って呼ばれた男性の潔白を証明している。
男性間の性交渉によって感染が広がるHIV-1グループMサブタイプBが北米に出現したことは、HIV/AIDSの世界的大流行における1つの転換点だったが、この転換の詳細は明らかになっていない。今回、Michael Worobeyたちは、もともと1970年代に米国で採取された血清検体から8つの完全長ゲノム配列を解読し、その当時、HIVがすでに遺伝的多様性を有しており、それ以前から起こっていたカリブ海地域での流行が起源であった可能性が非常に高いことを明らかにした。
また、Worobeyたちは、Patient Zeroと呼ばれた男性が保有していたHIV-1のゲノムを復元した。ランディ・シルツの著書“And the Band Played On”（邦訳『そしてエイズは蔓延した』）では、Patient Zeroの本名が明らかにされている。同書のマスコミ報道では、Patient Zeroが北米でのHIV流行の「原因」であることがほのめかされていた。これに対して、今回のWorobeyたちのゲノム解析では、Patient Zeroに由来するHIV-1ゲノムは当時の典型的な米国型株のものと考えられ、さまざまな種類の米国型株の基底に位置するものではなかったことが示されている。また、Worobeyたちは、この男性の本当の呼び名が“Patient O”であり、‘Out(side)-of-California’（カリフォルニア以外）の頭文字“O”が用いられていたのに“０”と誤って解釈されていたことも明らかにしている。この表記上の誤りが、そのまま科学文献に記載され、そのためにPatient Zeroの話は今でも広く信じられている。しかし、Worobeyたちは、Patient ZeroがHIV-1グループMサブタイプBに最初に感染した男性だったことを示す証拠を見つけることはできなかった。
今回の研究では、歴史的分析によって当時の状況を注意深く考慮に入れた初期のアーカイブ試料に由来する完全長のウイルスゲノムを用いることが大事で、それなしにはHIV/AIDSの世界的大流行における初期の顕著な出来事の詳細が解明できなかったことが明確に示されている。
The human immunodeficiency virus (HIV-1) ‘jumped’ from the Caribbean to New York City around 1970, triggering the subsequent North American epidemic, reports a paper published online this week in Nature. The study, which incorporates historical and genomic analyses, also clears the name of the man erroneously dubbed ‘Patient Zero’.
When the strain of HIV that infects men who have sex with men - HIV-1 group M subtype B - emerged in North America, it marked a turning point in the HIV/AIDS pandemic, but the details surrounding this transition are unclear. Michael Worobey and colleagues sequenced eight full-length genomes from serum samples originally collected in the USA dating from the 1970s, and show that the virus was already genetically diverse during this time and that it probably emerged from a pre-existing Caribbean epidemic.
They also recovered the HIV-1 genome of an individual known as ‘Patient Zero’. Patient Zero was identified by name in Randy Shilts’ book And the Band Played On. Media coverage of the book insinuated that this man was the ‘source’ of the North American epidemic. However, the genomic analysis performed by Worobey and colleagues indicates that the HIV-1 genome from this individual appeared typical of US strains of the time and was not basal to the US diversity. The authors also reveal that this man was dubbed Patient ‘O’ because he came from ‘Out(side)-of-California’, but the letter ‘O’ later became misinterpreted as the number ‘0’. This typographical error entered the scientific literature and, as a result, the story is still widely believed. However, the authors find no evidence that Patient 0 was the first person infected by this lineage of HIV-1.
The study highlights the importance of using complete viral genomes from early archival specimens, carefully contextualized through historical analysis, without which this detailed picture of the early landmarks in the HIV/AIDS pandemic would not have been possible.
doi: 10.1038/nature19827
「Nature 関連誌注目のハイライト」は、ネイチャー広報部門が報道関係者向けに作成したリリースを翻訳したものです。より正確かつ詳細な情報が必要な場合には、必ず原著論文をご覧ください。
注目のハイライト
メールマガジンリストの「Nature 関連誌今週のハイライト」にチェックをいれていただきますと、毎週最新のNature 関連誌のハイライトを皆様にお届けいたします。
