【ゲノミクス】オオムギのゲノムが解明された
Nature
オオムギのゲノム塩基配列が解読、解析された結果を報告する論文が、今週掲載される。このゲノム塩基配列情報は、穀物遺伝学と穀物ゲノミクスのためのコミュニティーの情報源として待望の注目すべき情報源であり、育種によるオオムギの改良・改変を目指す研究者にとって極めて重要な情報となる。
オオムギは、初めて栽培された穀物の1つだが、今では主要な穀物の1つとなっており、温帯地域で幅広く栽培されている。ところが、オオムギのゲノムの80％は反復配列とその他の解読の難しい配列が占めている。
今回、Nils Steinたちの研究グループは、ショットガン法による塩基配列決定と染色体規模でスキャフォールド配列を得る新しい方法などを組み合わせて用いることで、質の高い基準ゲノムを作成した。これは、コムギ、ライムギなどが含まれる植物分類群であるコムギ連（Triticeae）の穀物にとって初めての質の高い基準ゲノムだ。Steinたちは、この基準ゲノムを品種改良に活用する可能性を模索しようと、ヨーロッパのオオムギの優良系統（96系統）のコード領域の塩基配列を決定し、比較して、遺伝的多様性の特徴を明らかにし、強い選択の特徴を示す領域を同定した。強い選択は、例えば麦芽用オオムギと飼料用オオムギを生産するためのさまざまな性質を作り出すための品種改良があったことを反映している可能性がある。
The sequence of the barley genome is reported in this week’s Nature. A notable and long-awaited community resource for cereal genetics and genomics, the genome will provide vital information for researchers who seek to improve and modify barley through breeding.
One of the first grains to be cultivated, today barley is a major cereal crop, widely grown in temperate regions. However, 80% of the barley genome consists of repetitive sequences and other features that make it hard to sequence.
Nils Stein and colleagues used a combined approach, including shotgun sequencing and a new method using chromosome-scale scaffolding, to produce a high-quality reference genome. This represents the first high-quality reference genome for a member of the Triticeae tribe - the group of plants that includes wheat and rye. To explore how the genome could be exploited for breeding, the authors sequenced and compared gene-coding regions of 96 European elite barley lines, characterized genetic diversity and identified regions showing signatures of intense selection, which may reflect breeding to produce different characteristics, such as for the production of malting versus feed barley.
doi: 10.1038/nature22043
「Nature 関連誌注目のハイライト」は、ネイチャー広報部門が報道関係者向けに作成したリリースを翻訳したものです。より正確かつ詳細な情報が必要な場合には、必ず原著論文をご覧ください。
注目のハイライト
メールマガジンリストの「Nature 関連誌今週のハイライト」にチェックをいれていただきますと、毎週最新のNature 関連誌のハイライトを皆様にお届けいたします。
