【ゲノミクス】柑橘類の進化
Nature
ありふれた植物分類群の1つであるミカン属の起源について報告する論文が、今週掲載される。この論文では、ミカン属について、現在の分類学的思考に異議を唱える新たな進化の枠組みが提示されている。
ミカン属の樹木は、世界で最も広範に栽培されている果樹だが、ミカン属の起源と歴史は明らかになっていない。今回の研究で、Guohong Albert Wuたちの研究グループは、オーストラリアンフィンガーライムからクレオパトラマンダリンに至る60種の柑橘類のゲノム塩基配列解析を行った。そのうちの30種は、今回初めて塩基配列解析が行われた。Wuたちは、現存する柑橘類の樹木は、少なくとも10種の柑橘類の天然種に由来していることを報告している。ミカン属は、800~600万年前の中新世後期に多様化し、東南アジアに急速に広がったが、こうした変遷はアジアの夏季モンスーンの弱化と相関している。オーストラリアの柑橘類が多様化したのは、それよりもかなり後の約400万年前のことで、柑橘類がアジアとオーストラリアの分布境界線であるウォレス線を超えたのもその頃だった。
また、Wuたちは、柑橘類の野生祖先種に由来する市販品種の栽培化についても調べ、大粒のグレープフルーツに似たザボンという柑橘類の天然種の遺伝子が、マンダリン種に寄与した可能性のあることを明らかにした。
The origins of today’s citrus fruits are reported online this week in Nature, providing a new evolutionary framework for this common group of plants that challenges current taxonomical thinking.
Citrus trees are the most widely cultivated fruit trees in the world, but the origins and history of Citrus have been unclear. In this study, Guohong Albert Wu and colleagues analysed the genomes of 60 different citrus varieties, including 30 that are newly sequenced, from the Australian finger lime to the Cleopatra mandarin. Today’s citrus trees are descended from at least ten natural citrus species, they report. Citrus diversified during the late Miocene epoch, 6 to 8 million years ago, and spread rapidly through southeast Asia - a transition that correlates with the weakening of the Asian summer monsoons. Australian citrus fruits diversified more recently, around 4 million years ago, when they crossed the Wallace Line, a transitional zone between Asia and Australia.
The authors also studied the domestication of commercial citrus fruits from their wild ancestors, and they show that genes from the pummelo, a natural citrus fruit that resembles a large grapefruit, may have contributed to the mandarins.
doi: 10.1038/nature25447
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