感染症：COVID-19重症化の遺伝的リスク因子はネアンデルタール人から受け継いだと考えられる
Nature
COVID-19の重症化リスクに関連する遺伝的バリアントはネアンデルタール人から受け継いだ可能性があることを示した論文が、Nature に掲載される。ただし、COVID-19重症化のリスク因子は、高齢者、男性など数多く存在し、この遺伝的バリアントは、その1つにすぎない。
これまでの研究で、SARS-CoV-2に感染した者が呈する呼吸不全に関連する遺伝子クラスターが3番染色体上に特定されているが、今回、Hugo ZebergとSvante Pääboは、この遺伝子クラスターの起源を明らかにするため、ネアンデルタール人とデニソワ人（初期の現生人類に遺伝的バリアントをもたらした古代ヒト族）の古ゲノムを解析した。その結果、この領域の遺伝的バリアントが、ネアンデルタール人から受け継いだハプロタイプ（ある程度の数の遺伝子を含むゲノム領域）に由来することが明らかになった。このハプロタイプは、約5万年前の南ヨーロッパのクロアチア出身のネアンデルタール人に最も近く、現在のヨーロッパの人口の約16%、南アジアの人口の50%が保有している。
このハプロタイプの出現頻度が最も高いのはバングラデシュで、人口の63%が、ネアンデルタール人のリスクハプロタイプを少なくとも1コピー保有すると推定されている。COVID-19の重症化に集団間格差があることが観察されており、その一因が、このリスクハプロタイプの出現頻度差にあると考えられている。例えば、英国内のバングラデシュ系の人々は、COVID-19による死亡リスクが一般集団よりも約2倍高いとZebergとPääboは指摘している。
Genetic variants that are associated with the risk of severe COVID-19 may have been inherited from Neanderthals, reports a paper published in Nature. This is just one of many risk factors for severe disease, others include advanced age and being male.
Previous research has identified a gene cluster on chromosome 3 that is associated with respiratory failure upon infection with SARS-CoV-2. To determine the origins of the gene cluster, Hugo Zeberg and Svante Pääbo analysed the ancient genomes of Neanderthals and Denisovans (ancient hominins that contributed genetic variants to early modern humans). They discovered that the genetic variants in this region are derived from a large group of genes (known as a haplotype) that have been inherited from Neanderthals. This haplotype is most closely related to an approximately 50,000-year-old Neanderthal from Croatia, southern Europe. This haplotype is present in around 16% of the population in Europe and 50% of people in South Asia.
The highest frequency occurs in Bangladesh, where 63% of the population are estimated to carry at least one copy of the Neanderthal risk haplotype. The varying prevalence of this risk haplotype may contribute to the differences in severity of COVID-19 that have been observed between different populations. For example, individuals of Bangladeshi descent in the UK have about two times higher risk of dying from COVID-19 than the general population, the authors note.
doi: 10.1038/s41586-020-2818-3
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